Caso alguém esteja passando por dificuldade na instalação da Role Windows Server Update Service no Windows Server 2008 R2, é só baixar a versão WSUS 3.0 SP2.
Parece que o R2 foi distribuido com uma versão anterior do WSUS 3.0*, então é necessário baixar a versão mais nova, que é a SP2.
WSUS 3.0 SP2:
Detalhes. Download.
* Fonte: Technet